自然怀孕时，精子和卵子的结合，以及孕育成胎儿的整个过程，在母体这个“暗箱”中完成，我们无法将过程分解为小的步骤来分析。
但试管婴儿中，由于怀孕这个整体的过程中的一部分被放在了“体外”完成，因此我们可以将过程进行分解分析。
试管婴儿大体分为取卵周期和移植周期。取卵周期目标是得到高质量的受精卵，而移植周期中，在确保子宫内膜的基础上将受精卵移植会母体内，并以新生儿诞生为最终目标。因此我们可以说，一个高质量的受精卵、能接受受精卵的好的子宫内膜，以及能将受精卵成功孕育为胎儿的母体环境，是怀孕成立的三大要素。
【第一，高质量的受精卵】
高质量的受精卵有两种含义。一个是外观上的含义（形态），一个是内在的含义（染色体）。
外观上的含义是级别高的受精卵（形态、成长速度、内壁外壁细胞的数量、空腔大小等），通常来说，6AA、5AA是高级别的受精卵。经历过试管婴儿的患者都从胚胎师、医生口中得到过如下的报告，“本次取卵周期的结果是XX级别的受精卵XX个”。
另外一个含义是内在含义，“染色体正常的受精卵（23对染色体正常）”。这个含义无法用观察（显微镜下肉眼观察）而得到，需要经过精密检查（PGT-A技术，国内称三代试管）。目前，关于PGT-A（三代试管）在不孕治疗中的意义，美国和日本都没有得出明确的结论，在临床中，日本妇产科协会仅针对有限数量的诊所（联合试点研究的诊所）和特定的患者（即使移植了外观形态上优质的受精卵也会反复流产、反复不着床或生长停滞）进行实验，因此，对一般患者来说PGT-A（三代试管）还是相对陌生的概念。
正常受精后（受精当天），受精卵中出现1个卵子原核和1个精子原核，分别带有来自父母的23对染色体，即合计46对染色体。之后，在胚胎细胞分裂（外观）的同时，染色体（内在）进行复制和减数分裂（由46对染色体减少至23对染色体）。
受精卵的染色体异常就发生在这个复制的过程中。自身染色体正常的父母，也可能发生染色体异常的受精卵。导致受精卵染色体异常的机制目前尚未完全解析，但推测是由于卵子（主）和精子因衰老而缺乏能量所致。
另外，即使移植了高质量（外观）的受精卵也无法着床、生化妊娠（生化流产）、妊娠成立后无法度过安全期（9周之墙）等情况，90%以上是来源于受精卵自身的问题（内在，染色体问题）。
受精卵成长过程（外观）
【第二、接受受精卵的子宫内膜】
通常，在移植周期中，子宫内膜的厚度（外观）被用于确定是否符合移植标准（通常，月经第12天超声波检查结果，子宫内膜在8mm以上即被认为符合移植标准）。
另一方面，除了超声波“肉眼检查”可见的子宫内膜厚度，子宫内膜接受受精卵的时间（“着床窗口”）、子宫内膜的慢性炎症、子宫内的菌群平衡等“肉眼不可见”的因素（内在因素），也会影响胚胎的着床。
通常，如果发生移植高级别的受精卵后多次失败的情况，医生可能会建议患者进行子宫内膜的检查。
子宫内膜检查包括
子宫内膜着床能检查（ERA）：个人情况的着床时间窗口检查
子宫内膜组织检查：确认是否有慢性子宫内膜炎
子宫内菌群培养检查：确认子宫内的菌群是否平衡
【第三、孕育受精卵成长为胎儿的母体（母体免疫系统）】
最后，我想谈谈最复杂也是最重要的关键因素，母体免疫。
通俗地解释一下，受精卵和胎儿对母亲来说都是“异物”。那么，试图排除“异物”通常是人体免疫系统的功能。但是如果这个免疫系统正常工作的话，那么“怀孕”本身本来就不应该存在。但现实是，那些没有不育症、反复流产经历的人，都是可以正常怀孕生子的。也就是说，通常的人体机制来说，母体免疫系统是不会将受精卵或胎儿识别为异物。
另一方面，如果自身免疫系统的功能过强，免疫系统会启动并试图排除受精卵、胎儿这样“异物”。通常生活中自身免疫力超过其他人，对病毒入侵的抵抗力高于其他人，这并不是坏事儿，对日常生活也没有影响。但是怀孕过程中，自身免疫系统如果过强则可能导致怀孕无法持续（孕育胎儿）。这种情况被称为“母体免疫异常”，但是目前医学对发生机制尚不明确。
除免疫异常以外，如果母体凝血系统异常的话，会引起血液容易凝结而导致对受精卵供血不足，从而出现着床失败和反复流产。
对于出现反复着床失败或反复流产的情况，医生可能会建议患者进行凝血系统异常和自身免疫异常的排查。检验方法为验血，主要检验项目如下。
・抗核抗体 ・LA-DRVVT ・APTT ・抗CL抗体IgM ・抗CL抗体IgG ・蛋白质S和C活性 ・第12因子 ・抗CLβ2GP1抗体 ・Th1细胞/Th2细胞
※目前，日本生殖免疫专家对“Th1细胞/Th2细胞”在辅助生殖中的意义持有分歧意见。
【总结】
高质量的受精卵、接受受精卵的好的子宫内膜、孕育受精卵和胎儿的母体，是怀孕成立的三大要素。
即使移植好的级别（外观）的受精卵，多次出现生化妊娠、生化流产、怀孕成立后无法通过安全期（9周之墙）的情况，是这三大要素中的某个要素出现了问题，但是90%以上的原因为“受精卵质量问题（内在染色体异常）”。
子宫内膜的状态、母体免疫系统的状态占10%以下的原因。如果出现反复着床失败、或者疑似不育症的情况，可以将相关检查纳入视野。